工藤新一在与组织大战后随FBI一同前往了美国，因缺失解药而选择了放弃深爱的青梅竹马毛利兰，在其后意外恢复成人身体后与他一直相伴的宫野志保订婚。六年过去了，一个意外的案件让他发现组织依然存在，FBI却有意掩盖信息，然而更加意外的是他发现自己的未婚妻也闪烁其词……